概述

壹健生物科技(苏州)有限公司构建的环境 DNA 数据库旨在为生物多样性监测、生态评估及分子鉴定提供标准化、高质量的数据支撑,为此,本数据库系统整合了 20 个多来自全球多个权威公共核酸数据库与物种条形码资源库的数据,以及本地物种自主测序数据,并依据 NCBI 分类学体系(NCBI Taxonomy)对所有数据进行分类阶元的统一归并、修订与校验,确保物种鉴定与层级关系的准确性与一致性。数据库以年度为周期进行同步与更新,以确保物种宏条码数据的持续性与时效性。

目前数据库覆盖 12 个主要生物类群,13 种常用宏条码片段,涉及水生与陆生生物,涵盖动物、植物、真菌及原生生物等,包含从微生物到大型动植物的各类物种。截至目前,累计收录物种数超 60 万,宏条码(序列)记录超 1,400 万条。

数据库提供物种的传统分类和宏条码片段类型两种不同的展示方式,以满足不同查询需求。

传统分类

以传统生物学分类作为入口,展示数据库中目标类群下的各分类群的物种和宏条码的收录情况。物种按其所属的传统类群进行归类,并依据该类群内部的分类层级(如目、科、属、种)逐级展开,完整展示从高阶类群到具体物种(包含亚种)的分类学谱系。每个分类群均呈现对应的物种数与宏条码总数,并以可视化图表展示该分类群的下级分类单元及各基因片段的宏条码分布。

分类
物种数(包含亚种)
宏条码数
昆虫217,9685,794,185
有胚植物177,9781,818,978
真菌64,0952,740,834
底栖动物56,633993,015
鱼类25,274568,891
鸟类9,295105,799
爬行类8,098114,195
浮游植物8,024260,209
两栖类7,314145,828
哺乳类5,903218,892
浮游动物5,718166,900
原生动物4,936171,507

片段

以宏条码片段类型为入口,按照分类层级展示数据库中目标宏条码片段下各分类群的物种收录情况。每一层级均展示各分类单元在该片段宏条码数据库中的物种数及宏条码占比,并以饼图形式展示。

片段
物种数(包含亚种)
宏条码数
COI326,9287,141,421
ITS202,4302,979,702
28S155,451864,447
18S141,939804,523
trnL-F100,996277,176
16S(MT)87,352331,098
matK85,566286,509
rbcL84,859317,464
CytB72,701459,207
12S50,764168,016
trnH-psbA16,43740,192
p23S3,32430,029
16S1,42055,715
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壹健生物科技(苏州)有限公司成立于 2020 年 12 月,主营业务涵盖环境 DNA 系列产品、微生物组科研服务、基因芯片等技术产品,专注于环境生物安全检测与调控产品的研发与产业化。

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